A sequenciação de nova geração como uma abordagem promissora para a identificação da origem entomológica do mel
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Visão geral
resumo
O mel é um alimento muito consumido e apreciado em todo o mundo pelas suas
propriedades nutricionais e organoléticas, bem como pelos seus efeitos benéficos para a
saúde. No entanto, é também considerado um dos alimentos mais suscetíveis de ser
adulterado, quer pela mistura de mel de qualidade inferior, quer pela adição de açúcares,
ou pela rotulagem incorreta da origem botânica e/ou geográfica, entre outras possíveis
fraudes. Nos últimos anos, tem sido dada uma atenção crescente à origem entomológica
do mel, uma vez que esta também está relacionada com a origem geográfica. No âmbito
do projeto PRIMA “MEDIBEES” (https://medibees.org/), a sequenciação de nova
geração (NGS) será utilizada com vista ao desenvolvimento de ferramentas moleculares
que permitam identificar a origem entomológica de amostras de mel provenientes dos 8
países mediterrânicos do consórcio, de forma a diferenciar e valorizar méis produzidos
por abelhas autóctones destes países. Com este objetivo, inicialmente procedeu-se à
construção da base de dados das sequências de DNA mitocondrial das abelhas de modo
a incluir 10 subespécies mediterrânicas das 4 linhagens maternas (A, M, C e O). Para tal,
procedeu-se à extração de DNA e à respetiva sequenciação dos genomas completos, na
plataforma Illumina Novaseq 6000, de um total de 1095 abelhas destes países.
Posteriormente, utilizou-se o programa mitoZ 3.6 para fazer a montagem do genoma
mitocondrial de cada uma das amostras, resultando na seleção de 283 sequências
mitocondriais com boa montagem. Em seguida, foi utilizado o software MEGA 11, para
realizar o alinhamento destas sequências. A informação obtida será posteriormente
utilizada para a seleção de regiões com variantes (SNPs) informativos que possam ser
usadas para o desenho de primers adequados e desenvolvimento de ferramentas para a
identificação de méis produzidos por abelhas de diferentes linhagens mitocondriais e
respetivas subespécies.